Можно запустить в фоновом режиме мониторинг всех возможных параметров, особенно частот, температур и загрузки CPU и GPU, к примеру в RivaTuner, и пронаблюдать, что именно происходит в периоды падения fps. Исходя из полученных симптомов, можно будет дальше более конкретно ставить диагноз.
Необходимо только учитывать и не пугаться того, что в момент сворачивания полноэкранного WOW могут происходить две вещи: сама игра переходить в режим орграничения fps и видеокарта переключаться в 2D режим со снижениями частот GPU. Лучше всего наблюдать за параметрами паралельно на втором мониторе, либо включив на время испытаний оконный режим WOW, что кстати может изменить поведение fps.