Прокачался немного и понял всё. Действительно, урон выше, но, как оказалось, у команды Взять бонус к урону от шмоток заметно больше, чем у кобры. Чем больше прокачиваешь уровень эквипа, тем очевиднее разница в уроне становится. На уровнях ниже 90-100, разница практически незаметна.